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| 日本大学驻华代表处 |
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| 【北海道・东北地区】 |
| <国立>东北大学（中国代表处） |
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| 【关东・甲信越地区】 |
| <国立>筑波大学（北京办事处） |
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| <国立>千叶大学（上海代表处） |
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| <国立>电气通信大学（UEC中国教育研究支援中心） |
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| <国立>东京工业大学（中国代表处） |
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| <国立>一桥大学（中国交流中心） |
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| <私立>樱美林大学（中国事务所） |
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| <私立>庆应义塾大学（东亚研究所/上海代表处） |
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| <私立>上智大学（中国联络处） |
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| <私立>创价大学（北京办事处） |
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| <私立>大东文化大学（北京事务所） |
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| <私立>明治大学（北京办事处） |
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| <私立>立教大学（中国事务所） |
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| 理化学研究所（北京代表处） |
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| 【东海・北陆・近畿地区】 |
| <国立>金泽大学（北京事务所） |
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| <国立>名古屋大学（中国交流中心） |
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| <国立>丰桥技术科学大学（沈阳事务所） |
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| <国立>大阪大学（东亚学术研究中心） |
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| <国立>神户大学（北京事务所） |
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| <公立>大阪公立大学（大阪国际经济振兴中心上海代表处） |
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| <私立>南山大学（中国事务所） |
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| <私立>同志社大学（北京办事处·上海办事处） |
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| <私立>立命馆大学（北京办事处） |
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| <私立>京都艺术大学（上海事务所） |
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| <私立>关西大学（北京办事处·上海办事处） |
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| 【中国・四国地区】 |
| <国立>鸟取大学（北京事务所） |
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| <国立>岛根大学（岛根大学-宁夏大学国际共同研究所） |
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| <国立>冈山大学 |
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| <国立>广岛大学（北京研究中心） |
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| <国立>山口大学（山东国际合作中心） |
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| 【九州·冲绳地区】 |
| <国立>九州大学（北京事务所） |
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| <私立>久留米大学（北京教育交流中心） |
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